Dişlerdeki tedavi edilmeyen uzun süreli enfeksiyonlar sonucu köklerin etrafında çene filmlerinde koyu renle izlenen ve bazı durumlarda ağız içinde ve dişinle şişlikle kendini belli eden yapılar oluşur. Bu yapılar belirli özellikleri taşıyor ise kist olarak isimlendirilir. Çene kistleri sadece enfektif diş kökü çevresinde değil daha henüz ağıza sürmemiş olan dişlerin kron çevrelerinde de oluşabilir. Kistler oluşumlarına göre yapılarına göre çeşitli şekillerde sınıflandırılır. Bu yapıların bazıları tedavi gerektirmezken bazılarının alınması gerekmektedir. kistlerin çıkarılması cerrahi olarak gerçekleşir. Bu işlem ise kist operasyonu olarak adlandırılır.